La Sociedad Deportiva Santa Margarita fue fundada oficialmente en mayo de 1947, aunque ya en 1944 nuestro club jugaba partidos de carácter amistoso en As Mariñas, Arteixo y A Coruña, en los campos de La Fortaleza y Pedroso, que junto con el desaparecido viejo campo de La Granja eran los recintos donde nuestro fútbol modesto coruñés celebraba sus encuentros en aquellos años.
Los pioneros de la fundación de esta sociedad fue un grupo de jóvenes, entusiastas del fútbol, cuyos nombres conviene resaltar como homenaje a su iniciativa: Leopoldo Fraguela, Vicente López, Norberto Seoane, Nemesio Miras, Manuel Suero, Bernardino Mori y José Villar.
A lo largo de los casi 60 años de historia, la SD Santa Margarita ha conseguido numerosos éxitos deportivos: Varias veces campeón en las ligas locales de Primera y Segunda División; Campeón del Campeonato Gallego de Aficionados en la temporada 1959-60, torneo en el que participó con éxito en otras ediciones; Campeón de la Copa de La Coruña en la temporada 1966-67, tras vencer al Laracha en la final por 2-1. En categoria juvenil lleva compitiendo desde la temporada 1955-56 obteniendo numerosos títulos y llegando a participar en la Fase de Ascenso a la Liga Galega.
Por el club pasaron jugadores de gran valía como fueron, entre otros, los siguientes: Rábade, Aldao, José Maria, Seijas, Cortiñas, Mancedo, Maceiras, Franco, Tuja, Gago, Loló, Julián, Diego, Hermida, Ventureira, Yánez, Toñin, Traba, Areoso, y una larga lista de excelentes futbolistas que marcaron un hito en la historia del club.
En 1977 esta sociedad celebró su 50 aniversario con numerosos actos y una gran fiesta gastronómica, en la que se entregaron premios a todos los participantes, directivos, técnicos, socios y jugadores.
En la actualidad, la SD Santa Margarita cuenta con setenta jugadores en los equipos en las siguientes categorias: Aficionados: 2ª Regional. Juveniles: 1ª División local; Cadetes: 2ª División local; Infantiles: 2ª División local.
También es necesario destacar que este club organiza cada verano un torneo con la colaboración del Ayuntamiento y de Coca Cola. Este certamen cumplió este año su XII edición y en él participan equipos de A Coruña, As Mariñas y Arteixo.
En veteranos destacar que fueron campeones de Liga en 1972 y la temporada pasada fueron subcampeones de Segunda División, logrando el ascenso a Primera, bajo la dirección de Guillermo Seijas.