El Marte comenzó su andadura bajo el nombre de Wata-Bay, que era la denominación de un equipo de Venezuela del que era simpatizante Ramón Caramés Balboa, emigrado en aquel país. A su regreso decidió fundar un club con el mismo nombre, ocurría esto en el año 1936, aunque ya de inmediato tuvo que modificar la denominación pasando a llamarse desde entonces C.D. Marte.
Ha sido el Marte un club un tanto errante, que ha tenido que deambular de local en local, lo que impide que trofeos brillantemente ganados figuren en sus vitrinas.
Fue su primera sede el Bar Manolo, en la calle Angel Rebollo, de allí se trasladó a la Viña Gallega, en la calle Ramón del Cueto, haciéndolo posteriormente a la calle Comercial Hércules.
Mención especial merecen los fieles seguidores Manuel González 'Nenucho' y Fernando Díaz Pose, éste no dudó en acoger el club en su propio domicilio, en circunstancias difíciles para la entidad.
Después de todas estas vicisitudes, el club consiguió su propio local social en la calle Santo Tomás, 66 - bajo, cuando era presidente José Díaz Caamaño.
Entre los triunfos conseguidos por el club, hay que resaltar sobre todos cuando se proclamó campeón de La Coruña en la temporada 1941-42. Cuando venció al poderoso Silva por 3-1 en la final celebrada en el viejo campo de Riazor.
Otro hecho destacable es el ascenso logrado en la temporada 1954-55, bajo la dirección técnica de Enrique Nieto 'Henry'.
Y no se puede olvidar el gran éxito de los juveniles en la temporada 1970-71, en la que se proclamaron campeones de La Coruña y subcampeones gallegos.